Секвенцирање гена црног Рхино-а могло би спасити врсте од изумирања

21. век је фантастично време да будете биоинжењер и страшно време да будете црни носорог. Афричка врста, која је пре више од 850.000 година преживјела стотине хиљада становника, смањена је за брзо смањење броја становника од око 5.000. У нади да ће једног дана преврнути овај катастрофални пад, биолози покушавају да изврше редослед секвенцирања дицерос бицорнис бицорнис генома.

Пројекат је заједнички напор неколико биотехнолошких стручњака који се баве очувањем, укључујући патолога Универзитета из Васхингтона и биоинжинара Др. Цхарлес Мурраи и Маттхев Маркус, извршног директора Пембиента. Пембиент је биотехнолошка компанија из Сан Францисца која жели да преплави кинеска тржишта са синтетичким - али биолошки идентичним - рогом носорога, 3Д штампаним из лабораторијског кератина и можда испорученог као рино пиво. (Кератин је оно од чега су направљени ваши нокти и рогови од носорога. Није ни магично ни лековито.) Пембиент је могао научити довољно из генома једног носорога по имену Нтомби, рекао је Маркус Инверсе да би се побољшао начин на који синтетише протеине носорога.

Али пре него што било ко може да обрађује податке о генетици Нтомби, прво треба да се секвенцира црни геном носорога. Пројекат је отприлике на пола пута до подизања $ 16,500 на Екперимент.цом, платформи за цровдфундинг као што је Кицкстартер, осим за науку, а не за оживљавање дугорочних видео игара.

"Још увијек постоји релативно мало организама чији су геноми секвенцирани", каже Мурраи. "До недавно је то било веома тешко - дуготрајно и скупо."

То не значи да животиње не праве своје геноме. Пројекат Геноме 10К има за циљ да прикупи Нојеву арку генетских података. Јужни бели носорог, насељенији и већи, имао је секвенцу генома у 2012. Али шта је са црним носорозима као што је Нтомби? "Није јасно зашто су црни носорози тако дуго били остављени на страну", каже Маркус. Он одбацује пропуст до случајности; али могло би бити да, пошто су јужњачки белци већ били секвенцирани, црни носорог није био приоритет.

Маркус, Мурраи и њихови сарадници желе да искористе тај јаз. Нтомби, плакат носорога за пројекат, већ је извадио крв и сачувао - и, бинго! Рхино ДНА. Редослед треба да буде прилично једноставан, рекао је Мурраи. "Велика је помоћ имати геном бијелог носорога као мјерило."

Следећи кораци у низу

Са Нтомбијевом ДНК која је смештена на серверима ДНАнексус-а, биолози су поставили темеље компаративне геномике носорога. "Када добијемо њен редослед, можемо почети да схватамо шта је то носорог носорога, како се белац разликује од црног", каже Мурраи, "и пружи информације које ће помоћи у праћењу узорака на копну."

Ветеринари би могли проверити потенцијално гене који узрокују болести, и имати основу за успоредбу осталих седам подврста црних носорога - од којих су три већ изумрле.

Животиње после сутра

Једном када имамо чвршће разумијевање генетике црних носорога, неколико теоретских врата се отварају. "Низ цесту сам узбуђена због коришћења матичних ћелија да бих разумела физиологију носорога и, потенцијално, да у лабораторији узгајам рогове носорога како би се смањио криволов", каже Мурраи.

Маркус прогнозира мало даље. За дицерос бицорнис бицорнис, Маркус не предвиђа толико изумирање у стилу мамута, већ се враћа генетски сат; што су мање популације, то су склонији наслеђеним проблемима.

А за црне носороге који су нестали? Он упоређује овај напор са оним за секвенцирање северног белог носорога генома, пројекат који је у току у зоолошком врту у Сан Диегу. Говори се о покушају да се добије јужни бијели носорог (од чега их има 20.000) да носи сјеверни бијели носорога (од чега их има 5) до термина. Маркус говори са опрезним, опрезним оптимизмом: "Потенцијално - потенцијално - можда би изумрла подстипа црног носорога могла поново да се оживи."